Amarga Virus Buah Tomat Coklat Rugose nginfèksi tanduran tomat lan mrica ing ndonya, perusahaan wiji ngupayakake ngembangake tomat sing tahan.
Sumber daya genetik lan genom sing sugih kasedhiya kanggo peternak tomat sanajan sadurunge wiwitan proyek urutan genomik tomat. Koleksi plasma nutfah tomat gedhe wis suwe diadegake ing sawetara lokasi. Luwih saka 75,000 aksesi tomat disimpen ing bank gene ing saindenging jagad. Salah siji sing paling gedhe yaiku bank gene USDA ing Geneva, NY.
Urutan genome tomat diwiwiti ing taun 2005 minangka upaya multinasional antarane 14 negara lan rampung ing taun 2012. Upaya kasebut wis cepet banget kanthi aplikasi intelijen buatan, pembelajaran mesin lan algoritma canggih kanggo nganalisa data genetik lan fenotipik kanthi jumlah gedhe.
Tomat Pan-Genome
Peneliti saka Institut Boyce Thompson ing taun 2020 nggawe genom referensi berkualitas tinggi kanggo tomat liar kanggo ngasilake pan-genom tomat sing luwih lengkap lan migunani. Dheweke nemokake bagean saka génom sing ndasari rasa woh, ukuran lan ripening, toleransi stres lan tahan penyakit. Thanks kanggo sawetara teknologi sekuensing mutakhir sing bisa maca potongan DNA sing dawa banget, genom referensi luwih lengkap lan akurat tinimbang database sing ana.
Teknologi urutan lawas sing maca potongan DNA sing luwih cendhek ngenali mutasi ing tingkat basa tunggal. Nanging, dheweke ora bisa nemokake varian struktural kayata sisipan, pambusakan, inversi utawa duplikasi potongan gedhe saka DNA.
Ing taun 2019, klompok peneliti internasional mbangun pan-genome tomat nggunakake urutan genom saka 725 varietas filogenetik lan perwakilan geografis. Basis data iki kalebu 4,873 gen sing ora ditemokake ing génom referensi asli. Analisis variasi saiki / ora ana nuduhake mundhut gen sing akeh lan pilihan gen lan promotor negatif sing kuat sajrone domestikasi lan perbaikan tomat.
Waca artikel lengkap ing www.seedworld.com.