Wong lan tomat teka ing macem-macem wujud lan ukuran. Iki amarga saben individu duwe variasi genetik sing unik - mutasi - sing mengaruhi cara gen tumindak lan fungsi. Ditambahake bebarengan, mayuta-yuta variasi genetik cilik nggawe angel kanggo prédhiksi kepiye mutasi tartamtu bakal mengaruhi individu. Cold Spring Harbour Laboratory (CSHL) Profesor lan Howard Hughes Medical Institute Investigator Zach Lippman nuduhake carane variasi genetik ing tomat bisa mengaruhi cara mutasi tartamtu mengaruhi tanduran. Dheweke ngupayakake supaya bisa prédhiksi efek mutasi ing macem-macem varietas tomat.
Kombinasi mutasi sing beda-beda bisa mengaruhi ukuran tomat sing ora bisa ditebak. Ing gambar iki, kolom pisanan nuduhake tomat unmutated (WT). Kolom kapindho lan katelu nuduhake tomat kanthi mutasi siji ing wilayah promotor (R1 utawa R4) kanggo gen ukuran woh SlCV3. Mutasi individu duwe pengaruh cilik ing ukuran woh. Nanging kombinasi rong mutasi iki (R1 + R4) ngasilake woh sing luwih gedhe.
Ing panliten iki, Lippman lan tim nggunakake CRISPR, alat panyuntingan gen sing akurat lan ditargetake, ing rong gen tomat sing ngontrol ukuran woh, SlCV3 lan SlWUS. Dheweke ngasilake luwih saka 60 mutan tomat kanthi ngilangi potongan DNA cilik ing wilayah promotor, wilayah sing cedhak karo gen sing ngontrol ekspresi kasebut. Ing sawetara kasus, mutasi individu nambah ukuran tomat kanthi sethithik. Sawetara pasangan mutasi ora ngganti ukuran woh. Sawetara kombinasi sinergis nyebabake ukuran woh sing dramatis lan ora bisa diprediksi. Lippman ngandika: "Gil Suci nyata ing kabeh iki kanggo breeding potong punika predictability. Yen aku ngowahi urutan iki, aku bakal entuk efek iki. Amarga ana segara varian liyane sing dikumpulake dening alam ing cedhak mutasi sing sampeyan rekayasa, uga kasebar ing genom, akeh sing bisa mengaruhi mutasi spesifik sing sampeyan gawe.
Interaksi sawetara iki kanggo rong mutasi nggawe model akibat saka mutasi siji sing kedadeyan ing latar mburi genetik sing beda. Efek kasebut bisa dibandhingake karo sing ditemokake ing sawetara penyakit manungsa, ing ngendi sawetara wong bisa uga duwe mutasi sing wis ana sing bisa nglindhungi saka mutasi sing nyebabake penyakit.
Lippman lan tim bakal terus ngitung carane mutasi individu lan gabungan mengaruhi sipat potong tartamtu. Nganti saiki, dheweke wis ngukur interaksi antarane rong mutasi individu, nanging génom duwe jutaan variasi. Lippman ngarep-arep bisa nyinaoni interaksi sing bisa diukur kanggo nggawe breeding luwih bisa diprediksi lan efisien.
Kanggo informasi luwih lengkap:
Laboratorium Harbor Spring Dingin
www.cshl.edu